Pada 1993, Stasiun Jakarta Kota mendapatkan predikat cagar budaya, setelah mendapat surat Keputusan Gubernur DKI Nomor 475 Tahun 1993.
Stasiun ini memiliki 12 jalur rel kereta api dan berada di bawah Daerah Operasi (DAOP 1) Jakarta.
Dalam perkembangannya, semua kereta api penumpang jarak jauh dan menengah yang semula berhenti di stasiun ini direlokasikan ke Stasiun Pasar Senen. Selain itu, perjalanan kereta api lokal DAOP 1 bagian timur dipindahkan ke Stasiun Tanjung Priok.
Stasiun Jakarta kota otomatis hanya melayani KRL Commuter Line lintas Jabodetabek.
Simak breaking news dan berita pilihan kami langsung di ponselmu. Pilih saluran andalanmu akses berita Kompas.com WhatsApp Channel : https://www.whatsapp.com/channel/0029VaFPbedBPzjZrk13HO3D. Pastikan kamu sudah install aplikasi WhatsApp ya.